1984 yılında Adalar’ın önde gelen 22 kurucu isim tarafından kuruldu. Kurucu başkanı, dönemin kaymakamı M. Necati Karakayalı’dır. Vakfın kuruluş amacı, vakıf senedinde şöyle yazıldı: “Başta, Büyükada, Heybeliada, Burgaz ve Kınalıada olmak üzere, Adalar ilçesine bağlı tüm adaların tabii ve tarihi değerlerinin korunması ve geliştirilmesi; bu adaların temiz tutulması; daha medeni bir görünüm kazanmaları için gerekli çalışmaları yapmak; Aynı amaçlarla çalışan resmi ve özel her türlü kuruluşla işbirliği yapmak; Adalar’da oturanlara ve gezmeye gelenlere yardımcı olmak; olanaklar elverdiği ölçüde, onlara her türlü yardımda bulunmaktır.”

Adalar Vakfı, 2001 yılında Heybeliada’da, ünlü romancılarımızdan Hüseyin Rahmi Gürpınar evinin restorasyonu ve müzeye dönüştürülmesi, müzenin ziyarete açık tutulması; 2010 yılında Büyükada’da Adalar Müzesi’nin kurulması ve işletilmesi gibi önemli projeleri gerçekleştirdi. Vakfın sahibi olduğu Adalı Dergisi 2003’den bu yana düzenli olarak ve aylık periyodlarla yayımlanmakta. 2004 yılında kurulan Adalı Yayınları, Adalar için özgün ve telif niteliğinde 70’e yakın kitap yayımladı. Adalar’ın ilk kültür evi sayılan Adaevi’ni 2007 yılında kurdu. Büyükada Çelik Gülersoy Kültür ve Sanat Merkezi de, Adalar Müzesi ile birlikte aynı yıl 2010 yılında vakıf tarafından düzenlenerek hizmete açıldı. Adalar Vakfı, Adalar’ın en eski ve önemli sivil toplum kuruluşları arasındadır. Vakfı günümüzdeki başkanı Ali Erkurt'tur.