Koç Holding’in iştiraki Setur Grubu, marinada 1997 yılı itibarıyla hizmet vermeye başladı. Setur Ayvalık Marina, Balıkesir’in en önemli sayfiye yerlerinden olan Ayvalık ilçesinin şehir merkezinde yer almaktadır. Marina, konum olarak kuzey Ege’de sakinlik ve doğal güzellik arayan yatçıların bağlama yaptığı, kuzey-güney seyirlerinin önemli noktalarındandır. Son yıllarda Ayvalık’ta popülerleşmesi ve ülkede artan refah seviyesine paralel olarak yerli yatçı sayısındaki artış, marina için önemli avantaj sağlamaktadır. Her ne kadar söz konusu bölge Güney Ege kıyılarındaki gözde seyir rotaları dışında kalsa da; özellikle İstanbul, Bursa, Çanakkale ve Balıkesir gibi önemli sanayi ve ticaret merkezlerinin yakın olması, Marina için büyük önem taşımaktadır. Bu sayede Marina, bölgedeki yatçılar tarafından tercih edilen ve sadece yaz döneminde değil, kışın güzel havalarda da seyir yapmak amacıyla ziyaret edilen bir tesis haline geldi. Ayrıca, yakın zamanlarda hayata geçirilen altyapı ve üstyapı iyileştirmeleri sayesinde marina doluluğunu arttırmaktadır.

Marina’nın yat bağlama kapasitesi denizde 250, karada 100 olmak üzere toplam 350 adettir. Maksimum 40 metreye kadar olan teknelere bağlama hizmeti verilebilmektedir. İskelelerdeki maksimum derinlik 4,7 metredir. Marina’da yatlara ve marina kullanıcılarına yönelik palamar bot, dalgıçlık, elektrik, su, duş-tuvalet, otopark, kablosuz internet, atık alım, akaryakıt istasyonu, kiralık depo, yangın ihbar ve yangın söndürme, 24 saat kamera destekli güvenlik gibi hizmetler sunulmaktadır. Çekek sahasında bulunan maksimum 88 ton kapasiteli gezer vinç (travel lift) ile teknelere çekme-atma, alt-yıkama, karada konaklama gibi hizmetler de verilmektedir. Yüzer iskeleler, koçboynuzları, mapalar, aneleler, krom/nikel malzemeler, elektrik-su tesisatları, servis kutuları gibi sistemler yenilenerek; elektrik-su kullanımında kartlı sisteme (ön ödemeli) 2012 yılında geçildi. Çekek sahasında konaklayan tekneler için çelik payanda sistemleri kullanılmaya başlandı. Ayrıca Marina sahasındaki rüzgâr duvarları yenilendi, Marina içerisinde su sirkülâsyonunun sağlanması için menfez sistemi oluşturuldu. Marina’da bulunan sosyal ve ticari üniteler kapsamında kafe-restoran, yat market, yat acentası, süpermarket, tamir-bakım atölyeleri gibi işletmeler bulunmaktadır. Şehir merkezinde olması dolayısıyla Marina kullanıcıları, şehirdeki çok sayıda yeme-içme, eğlence gibi faaliyetlerden ve çeşitli tesislerden faydalanabilmektedir. Marina, İzmir Adnan Menderes Havalimanı’na 150 kilometre, Edremit Kocaseyit Havalimanı’na 38 kilometre ve Ayvalık Otogarı’na iki kilometre uzaklıktadır.