İlk olarak Kız Meslek Lisesi olarak faaliyetlerine başladı. Lise binası, 1947 ile 1952 yılları arasında avukat olan Fethi Pekin tarafından Kızlarımız Okusun niyetiyle annesi Şefika Hanım’ın anısına yaptırıldı. Muğla/Fethiye Anadolu Kız Meslek Lisesi, 1954–1955 öğretim yılında Akşam Sanat Okulu, 1968–1969 öğretim yılında Kız Sanat Ortaokulu, 1971–1972 öğretim yılında da bakanlığın izni ile Kız Meslek Lisesi olarak eğitim-öğretime başladı. 6. 11. 1990 tarihinde hayırsever vatandaş olan Fethi Pekin’in annesinin adı ile yeni Şefika Pekin Kız Meslek Lisesi binalarında eğitime açıldı. Bu günlerde okul, 1990 tarihinden itibaren Şefika Pekin Mesleki ve Teknik Anadolu lisesi adı ile eğitim öğretim faaliyetlerine devam etmektedir. 2008–2009 öğretim yılından itibaren ikili eğitime geçti, 2013-2014 öğretim Yılında Gülşen Gökçe Kız Meslek Lisesi'nin açılması, Şefika Pekin Kız Meslek Lisesi’ne yaptırılan iki adet derslik ve bir mutfak atölyesinden sonra ikili eğitimden normal eğitime geçti. Ayrıca 01. 03. 1973 tarihinden itibaren Uygulama Anaokulu olarak faaliyet göstermekte olan okul, 2014-2015 öğretim yılından itibaren turizm alanında eğitim vermeye başladı ve Anadolu Meslek Konaklama ve Seyahat Hizmetleri Alanı, Rezervasyon dallarında faaliyete geçti. Fethiye Şefika Pekin Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi Konaklama ve Seyahat Hizmetleri Bölümü 2015-2016 eğitim-öğretim yılında rezervasyon dalı olarak eğitim faaliyetlerine başladı ve hâlen bu faaliyetleri sürdürmektedir. Lise bünyesinde Anadolu Meslek Lisesi kapsamında Çocuk Gelişimi ve Eğitimi, Yiyecek-İçecek Hizmetleri, Giyim Üretim Teknolojisi, Grafik-Fotoğraf, Konaklama ve Seyahat Hizmetleri Alanı gibi farklı alanlar bulunmaktadır. Mesleki Açık Öğretim Lisesi kapsamında (Çocuk Gelişimi ve Eğitimi Erken Çocukluk Eğitimi dalı) Uygulama Sınıfı bulunmaktadır. Lisenin bulunduğu alan 5531 metrekaredir. Birinci kat İdari kat ve beş bloktan oluşmaktadır. Okulda 13 derslik, beş atölye, bir kütüphane, 250 kişilik toplantı salonu, bir öğretmenler odası, bir arşiv odası, iki rehberlik servis odası, bir öğrenci kantini ve bir hizmetli odası, bir sayman odası bulunmaktadır. Okul bünyesinde bir müdür, bir baş muavin, beş müdür yardımcısı, 47 öğretmen, bir sayman, bir memur, bir kadrolu, üç ücretli toplam dört hizmetli görev yapmaktadır.