Balıkesir Üniversitesi Senatosu'nun kararı ile kurulan Erdek Meslek Yüksekokulu, Turizm ve Otelcilik ve Mahalli İdareler olmak üzere iki bölüm ve 60 öğrenciyle eğitim-öğretim faaliyetlerine başladı. Bölümlerin isimleri daha sonra Turizm ve Otel İşletmeciliği ve Yerel Yönetimler olarak değiştirildi. 2000 yılında Turizm ve Otel İşletmeciliği Bölümünün, 2004 yılında da Yerel Yönetimler Bölümünün ikinci öğretim programları açıldı ve öğrenci sayısı yaklaşık 400’e ulaştı. Erdek Kamplar bölgesinde sahilde yer alan Eski Vakıflar Kampı 2007 yılında üniversiteye tahsis edilmiş olup Yüksekokul, 2008-2009 eğitim-öğretim yılından itibaren burada faaliyetlerini sürdürmektedir. Erdek Meslek Yüksekokulu, 23. 04. 2015 tarih ve 29335 sayılı Resmî Gazete’de yayınlanan 6640 sayılı Kanun ile kurulan Bandırma Onyedi Eylül Üniversitesi’ne bağlı sekiz meslek yüksekokulundan biri olarak eğitim-öğretim faaliyetlerine devam etmektedir. Ekim 2019 itibariyle Erdek Meslek Yüksekokulu’ndan mezun olan toplam öğrenci sayısı 2.137’dir.

Türkiye’nin önemli iç turizm destinasyonlarından biri olan Erdek’te faaliyet gösteren Yüksekokul bünyesinde bulunan Turizm ve Otel İşletmeciliği Bölümü, öğrencilerin uygulamalı bir eğitim-öğretim ortamında dinamik bir sektör olan turizme dair günümüz koşullarına uygun bilgilerle donatılarak yetiştirilmesi amacını taşımaktadır. Bölümün eğitim-öğretim programında öğrencilerin hem sektöre ara eleman olarak kazandırılması amaçlı mesleki donanımlarını geliştirmeye yönelik derslerin hem de turizm sektörünün çeşitli alt dallarında faaliyet gösteren işletmelerde yönetime yardımcı olacak şekilde gelişmelerine imkân veren teorik derslerin olduğu görülmektedir. Erdek Meslek Yüksekokulu'nun yerleşkesi içinde bulunan 57 oda kapasiteli otel binası ve 675 metrekare kapalı alanı bulunan restoran binası uygulamalı eğitime olanak tanımaktadır. 30 iş günü staj yapma zorunluluğu bulunan öğrenciler, Erdek’te bulunan turizm işletmelerinde iş ve staj imkânı bulabildikleri gibi Türkiye’nin önemli birçok turizm destinasyonunda hizmet veren işletmelerde de görev alabilmektedir. Bölümden mezun öğrenciler içerisinde turizm sektöründe aktif bir şekilde var olan ve konaklama ya da seyahat işletmelerinin kilit pozisyonlarında yer alan öğrencilerin sayısı fazladır. Erdek Meslek Yüksekokulu'nun kadrosunda toplam 12 akademik personel bulunmaktadır.