İstanbul’un Asya Yakası’na giriş yapan otobüslerin Kadıköy-Üsküdar hattı üzerinde trafik sıkışıklığı yaratması sonucu, Harem otogarı 1970 yılında faaliyete geçti ve işletmesi 1997 yılında İstanbul Büyükşehir Belediyesi tarafından Üsküdar belediyesine devredildi. Terminal, Üsküdar ilçesi Harem mevkiinde 70.640 metrekare alan üzerinde, 57 adet şehirlerarası otobüs yazıhanesi faaliyet göstermekte olup; 16 otogar personeli, 640 yazıhane personeli hizmet vermektedir. Terminalde, kapasite mevsimsel olarak değişmekle beraber bu sayı kış aylarında günlük 600 otobüs, yaz aylarında ise günlük 850 otobüstür. Günlük binen yolcu sayısı 9120 kişiyi bulmaktadır.

Terminal alanında berber, emanetçi, WC, konfeksiyon mağazaları, oyuncak ve pişmaniye dükkanı, pastane, kafeterya, çay ocağı, büfe gibi yolcuların kullanımına yönelik çeşitli hizmet noktaları da bulunmaktadır. Terminalde, sivil araçların giriş çıkışında kontrol etmek amacıyla giriş çıkış zemininin onarımı yapılarak iyileştirme çalışmaları yapıldı.

Terminal, İstanbul şehrinin Asya Yakasına giriş yapabilek ulaşım merkezidir. Terminalde hizmet veren otobüs firmaları Türkiye’nin her bölgesine seferler düzenlemektedir. Otogar alanına denizyolu araçları, özel araç, özel halk otobüsü, belediye otobüsü, şehirler arası otobüs servisleri ile ulaşmak mümkündür. Ancak, Harem otogarı Fatih köprüsü ile birlikte kullanıcılar için TEM otoyolu ve D–100’e transit bağlantısı noktasında oldukça yetersiz kaldı. Harem otogarı metropol için yetersiz kalmış ve bulunduğu yerde önemli sorunlar oluşturmaktadır.

Anadolu Yakası’nın farklı noktalarında otobüs firmalarının kendi terminallerini açmasıyla Harem Otogarı’nın önemi azaldı. Terminalin Haydarpaşa liman projesi alanı içinde kaldı ve şehirlerarası otobüsler için Üçüncü Köprü ve Kuzey Marmara Otoyolu kullanımı zorunlu hâle gelmesiyle işlevini kaybetti. Bunun sonucunda yeni terminal Pendik Kurtköy’de Sabiha Gökçen Havalimanı’nın iki kilometre uzağındaki 64 bin metrekarelik yeni yerine taşınacaktır. Yeni termalde, yolcu bekleme salonları, otobüs ve taksi durakları, 200 araçlı otopark ve 23 adet yolcu peronu olması öngörülmektedir.