Selçuk Üniversitesi Rektörlüğü tarafından, Anadolu Selçuklularının yaşadığı döneme ait tarih, kültür ve sanatla ilgili araştırmalar yapmak için 1985 senesinde Selçuklu Araştırma Merkezi kuruldu. Bu merkezin amacı, Anadolu Selçuklu tarihi, Selçuklu şehrinin yapısı, mimarisi, güzel sanatlara ait bütün alanlar, bilim tarihi, şehir yapıları ve kazı çalışmalarına ışık tutmak ve onları gün yüzüne çıkarmaktır.

Konya Selçuk Üniversitesi Müzesi Alaeddin Keykubat Kampüsü içersinde yer almaktadır. Kültür ve Turizm Bakanlığı’na bağlı olan müze binası, Selçuk Üniversitesi'nin rektörü Prof. Dr. Hakkı Gökbel öncülüğünde 2018 yılında açıldı.

Müze binası toplam 8.870 metrekare alana sahiptir. Müzenin içerisinde yaklaşık olarak 2500 civarı eser bulunmaktadır. Resmi bir açılış olmadığı için eserler şu an depoda muhafaza edilmektedir. Eserler müzeye 2019 yılında getirildi.

Müze binası, modern ve geleneksel mimari yapıların bir arada kullanılmasıyla dikkat çekmektedir. İki kattan oluşan müze binasında 12 adet derslik, 23 adet ofis, 216 kişilik konferans salonu, teşhir, sergi ve toplantı salonları da bulunmaktadır. Bina sanat kompleksi şeklinde hazırlandı. Müzenin dış cephesinde taş kaplamalarda bulunmaktadır.

Müzede yer alan tarihi eserlerin çoğunluğu Konya’da bazı müzelerde yer alan özel koleksiyon sahiplerinin en önemli eserlerinden oluşmaktadır. Müzede, Çatalhöyük’teki buluntular da yer almaktadır.