Kökleri 1868 yılına dayanan Galatasaray Müzesi, II. Napolyon’un hediye ettiği içi doldurulmuş bir mamuta dayanmaktadır. 1909 yılında kulüp genel kurul tarafından resmi olarak ortaya atılan müze fikri, 1912 yılında Galatasaray Spor Kulübü’nün kurucusu Ali Sami Yen ile Kalamış’ta hayat buldu. 1905 yılında kurulan kulübe ait o döneme kadar kazanılan kupalar, madalyalar ve flamalar bu müzede sergilendi. Birinci Dünya Savaşı’nın sonunda müzedeki eserler, güvenlik nedeniyle bugünkü Galatasaray Lisesi’ne taşındı.

Müzenin birinci katında 1. 09. 1868 tarihinde Sultan Abdülaziz tarafından kurulan Mekteb-i Sultani’nin günümüze kadar gelen kronolojik gelişimi anlatılmaktadır. Bu bölümde öğrenci üniformaları, derslerde kullanılan aletler, okul sıralarında çekilmiş fotoğraflar yer almaktadır. İkinci katta ise Galatasaray Spor Kulübü’nün 1905 yılından günümüze kadar gelen hikâyesi görsel öğeler ve spor kulübü için önem arz eden eserler görülmektedir. Metin Oktay`ın dokuz numaralı sarı kırmızı çubuklu forması, maç öncesi ve esnasında çekilmiş fotoğraflar, müsabakalarda kullanılan krampon ve spor kıyafetleri gibi pek çok nesne müzenin koleksiyonunda yer almaktadır.

Kulübün kazandığı ilk kupa olan Union Clup Kupası gibi tarihinde önem teşkil eden futbol alanında süper lig kupası, Türkiye Kupası, Başbakanlık Kupası; basketbol erkek ve kadın branşında kazanılan kupalar gibi farklı mecralardaki değerli pek çok ödül müzede yer almaktadır.

Atatürk’ün Galatasaray Lisesi’ni ziyaret ettiğinde kahve içtiği fincanı, imzalı fotoğrafı, Atatürk’ün kulüp defterine yazdığı imzalı notlarını da bu müzede görmek mümkündür. Geçici sergileri aralıklarla devam ettiren galerinin ilk sergisi 26. 02. 2010 tarihinde Bir Numaralı Galatasaraylı: Ali Sami Yen başlığıyla kurucusu Ali Sami Yen anısına açıldı. Galatasaray Lisesi ve kulüp tarihine ait pek çok önemli belge ve nesnenin korunduğu müzede güncel sergiler ile bu tarih canlı tutulmaya çalışılmaktadır.