Kastamonu Üniversitesi’nin üç yüksekokulundan biri olan Sivil Havacılık Yüksekokulu, ilk olarak Gazi Üniversitesi çatısı altında Gazi Üniversitesi Sivil Havacılık Yüksekokulu olarak kuruldu (1992). Kastamonu Üniversitesi’nin 17.03.2006 tarihli Bakanlar Kurulu kararı ve 5467 sayılı yasa ile Gazi ve Ankara üniversitelerinden ayrılmasının ardından 13.06.2011’de Sivil Havacılık Yüksekokulu’nun Müdür ve İdari Personel atamaları gerçekleştirildi ve 2006 yılı itibariyle okulun faaliyete geçmesine yönelik çalışmalara başlandı.

Kastamonu Üniversitesi Sivil Havacılık Yüksekokulu'nun bünyesinde Havacılık Yönetimi, Havacılık Elektrik Elektroniği ve Uçak Gövde-Motor Bakım bölümleri bulunmakta olup bu bölümlerden öğrencisi olan tek bölüm Havacılık Yönetimi Bölümüdür. Havacılık Yönetimi Bölümü 2018-2019 eğitim öğretim döneminde ilk kez öğrenci aldı ve YÖK tarafından kendisine ayrılan 40 öğrenci ile ders dönemine başladı. 2019-2020 eğitim-öğretim yılında ise Havacılık Yönetimi Bölümünün ikinci öğretim programı açıldı ve ilgili yılda 60 Birinci Öğretim, 60 ikinci öğretim olmak üzere 120 öğrenci daha eğitim-öğretim görmek üzere yüksekokulun bünyesine dâhil edildi.

Kastamonu Üniversitesi Sivil Havacılık Yüksekokulu'nun akademik kadrosunda Havacılık Yönetimi Bölümünde iki öğretim üyesi ile iki araştırma görevlisi, Uçak Gövde-Motor Bakım Bölümünde ise iki araştırma görevlisi olmak üzere toplamda iki öğretim üyesi, dört araştırma görevlisi bulunmaktadır.