SOS Akdeniz Bürosu tarafından yayımlanan Ağaçkakan Dergisi’nin ilk sayısı Eylül 1992 tarihinde yayımlandı. Derginin ilk sayısında Neden Ağaçkakan! başlıklı önsözünde derginin yayımlanma amacı; “… bu dergide soluklanıp; nefesimizin, zihnimizin yettiğince ama 'umut'la taptaze dolu olarak yolla düşeceğiz birlikte.. Nereye mi? Mümkün mertebe her yere; hayatımıza değen, teğet geçen, ıskalayan, çarpan, nüfus eden, içselleşen herşeye doğru…” şeklinde açıklanmıştır.

Ağaçkakan Dergisi, yeşil hareket içinde yer alan ekososyalistler, ekofeministler, derin ekolojistler ve anarşistler gibi farklı akımların temsilcilerinin yazdığı bir yayın oldu. Derginin sahipliğini SOS Akdeniz Bürosu adına Alev Çamsarı, yazı işleri müdürlüğünü Ayşe Tosuner ve yayın koordinatörlüğünü ise Savaş Emek yerine getirdi. Dergi, son dönemde Savaş Emek’in koordinatörlüğünde yayımlandı.

Dergi, 1992-2003 yılları arasında aylık olarak toplam 40 sayı yayımlanabildi. İlk sayısındaki Nükleer Balayı dosyasında olduğu gibi çok sayıda dosya yazısı yayımlandı. Ağaçkakan Dergisi’nde nükleer enerji, endüstriyalizm, yeşil hareket, eko-feminizm, teknoloji, tarım, turizm, kimyasallar ve kent sorunları üzerine yazılar yayımlandı.